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在自然界，存在着许多对害虫有致病作用的微生物，利用这种致病性来防治害虫是一种有效的生物防治方法。从这些病原微生物中筛选出施用方便、药效稳定、对人畜和环境安全的菌种，进行工业规模的生产开发，从而制成微生物杀虫剂。
微生物杀虫剂种类很多，已发现的有２０００多种，按照微生物的分类可分为细菌、真菌、病毒、原生动物和线虫等。目前，国内研究开发应用并形成商品化产品的主要有细菌类杀虫剂、真菌类杀虫剂、病毒类杀虫剂。
细菌杀虫剂
细菌类杀虫剂是国内研究开发较早的生产量最大、应用最广的微生物杀虫剂。目前，研究应用的品种有苏云金杆菌、青虫菌、日本金龟子芽孢杆菌和球形芽孢杆菌，其中苏云金杆菌是最具有代表性的品种。
苏云金杆菌(Bt)是一种能产生伴孢晶体毒素，昆虫寄主谱较广的重要昆虫病原菌，是一种胃毒性杀虫剂。我国现已通过国家农药行政主管部门注册的Ｂｔ生产厂家近７０家，年产量超过３万吨，产品剂型以液剂、乳剂为主，还有可湿粉、悬浮剂。大量的试验和实际应用表明，苏云金杆菌对多种农业害虫有不同程度的毒杀作用，这些害虫包括棉铃虫、烟青虫、银纹夜蛾、斜纹夜蛾、甜菜夜蛾、小地老虎、稻纵卷叶螟、玉米螟、小菜蛾和茶毛虫等，对森林害虫松毛虫有较好效果。另外，还可用于防治蚊类幼虫和储粮蛾类害虫。
真菌杀虫剂
真菌杀虫剂是一类寄生谱较广的昆虫病原真菌，是一种触杀性微生物杀虫剂。目前，研究利用的主要种类有：白僵菌、绿僵菌、拟青霉、座壳孢菌和轮枝菌。
白僵菌白僵菌是我国研究时间最长和应用面积最大的真菌杀虫剂。从上个世纪６０年代起，国内开始研究利用白僵菌防治林业害虫松毛虫和农业害虫玉米螟，至７０年代，已开发出固相培养和液固两相生产方法和应用技术，并陆续建厂生产白僵菌粗产品，大面积防治松毛虫和玉米螟。到在产品剂型上，目前我国已开发出粉剂、可湿粉剂、油剂、乳剂和微胶囊剂。目前，白僵菌的研究开发重点在工业化生产技术、质量标准体系、剂型和产业化技术等方面。我国白僵菌生产厂仅１０家左右，企业规模小，采用的生产工艺多为固相浅盘、窗纱开放式培养，生产的产品质量不稳定，大多未能达到规模化生产，产品自产、自销、自用。白僵菌的寄主很多，可防治对象有玉米螟、松毛虫、多种金龟子、水稻叶蝉、飞虱、桑天牛、茶小叶蝉、茶毛虫、大豆食心虫和蚜虫等，特别是对玉米螟和松毛虫，已作为常规手段连年使用。
绿僵菌绿僵菌是一种广谱的昆虫病原菌，在国外应用其防治害虫的面积超过了白僵菌，防治效果可与白僵菌媲美。我国研究开发绿僵菌起步晚，经过多年的研究开发在菌株选育、生产工艺、剂型和防治对象上已有长足进步。目前，重庆大学基因研究中心完成了杀蝗绿僵菌生物农药的研制，取得了重要的研究成果，并完成了产品登记注册，生产的产品已在国内多个省份示范试验。
其他真菌除白僵菌、绿僵菌外，其他真菌也表现出了很好的杀虫潜力。淡紫拟青霉能有效的防治柑桔、柠檬和马铃薯等多种作物根结线虫，对大豆孢囊线虫也有较好的防治效果。粉拟青霉、玫烟色拟青霉防治松毛虫和温室白粉虱均取得了明显的效果。双座壳孢菌可防治刺棉蚜，蜡蚧轮枝孢可防治蚜虫、蓟马和白粉虱。
病毒杀虫剂
病毒杀虫剂是一类以昆虫为寄主的病毒类群，虽研究开发比细菌杀虫剂晚，但近年来发展迅速。 应用比较普遍的有核型多角体病毒(NPV)、颗粒体病毒(GV)和基因工程棒状病毒。我国科技人员经过多年的努力，已开发出多种野生型昆虫病毒复合杀虫剂产品，并实现商品化。利用基因工程技术开发的重组病毒杀虫剂也已进入田间释放阶段。从1993年国内第1个昆虫病毒杀虫剂——棉铃虫核型多角体病毒完成产品注册登记至今，已有10几家产品获得登记，包括：棉铃虫、斜纹夜蛾、菜青虫、黄地老虎和茶尺蠖等，年产量约2000t。
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