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在低资源设置评估HIV病毒载量 | |||
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以下三个通用的方法是目前检测和量化HIV RNA逆转录聚合酶链反应(RT-PCR),核酸序列的扩增(NASBA)和支链的DNA(BDNA)的发展中经济体。每个方法都需要三个步骤:样品制备和病毒核酸提取,扩增的靶核酸序列,或从目标病毒RNA的检测信号产生,检测和/或定量的扩增产物。
RT-PCR使用反向转录酶转换成互补DNA(cDNA)的,然后复制,从而可以检测到病毒RNA。在该方法中,RT-PCR量化艾滋病毒的RNA,使病毒载量的测定。
NASBA法是一种等温扩增方法,其中被放大的靶RNA一个三酶系统,通过竞争性共扩增控制定量。这种方法不再需要为热稳定的酶和热循环用于RT-PCR所使用的工具目前,以下四个市售的病毒载量测定的所有使用这些通用的方法之一:罗氏分子系统,实时HIV-1由Abbott实验室,Versant的HIV-1 RNA 1.0试验(KPCR COBAS AmpliPrep和COBAS TaqMan探针2.0)西门子医疗诊断和生物梅里埃的NucliSENS EasyQ HIV-1 V2.0 4,6COBAS TaqMan探针HIV-1 COBAS TaqMan探针HIV-1检测是在体外核酸
扩增检测HIV-1 RNA人血浆中科瓦斯AmpliPrep仪器的自动化样品处理和COBAS TaqMan探针分析仪或COBAS TaqMan探针48分析仪自动化扩增和检测的定量分析。这是一个完全自动化的,实时PCR系统目标gag和LTR区的HIV基因组,这会导致在检测下限。
的COBAS TaqMan探针HIV-1的检测只需要若干技术,具有很宽的动态范围,是完全自动化的(包括样品转移),并进行分析,只需要一个单间,但它也有一些缺点。为了执行COBAS TaqMan探针HIV-1检测,都需要一些专门的实验室空间和设备,适中的技术支持是必不可少的。该设备也是昂贵的,通常是可望而不可及的任何发展中世界的设施,可提供空间和支持。
实时HIV-1。雅培实时HIV-1检测采用实时荧光定量PCR,但不像TaqMan探针,它的目标是POL艾滋病毒基因组的整合区域。HIV RNA定量是一个自动化的过程使用m2000sp样品制备和核酸提取,扩增和检测m2000rt 雅培实时检测的6个
主要优势包括其高吞吐量,动态范围大,而事实上,它可以是一个完全自动化的,在PCR过程中的封闭系统。此外,该设备可用于评估HIV以外的其他病原体。然而,作为的COBAS TaqMan探针的,这个系统需要专用设备和空间,良好的技术支持,并有相当的金融投资。
Versant的HIV-1 RNA 1.0 Versant的HIV-1 RNA 1.0检测(BDNA)是一个自动化的检测,还针对HIV基因组的的聚合酶整合区域,再次使用的样品准备模块和扩增/检测模块。
Versant的实验也有高吞吐量和可以完全自动化,降低了污染的风险较PCR。没有特定的实验室或需要单独提取区域,的设备,也可用于评估其它病原体。然而,Versant面向检测的主要缺点包括需要熟练的技术人员,良好的技术支持和财力。的NucliSENS EasyQ。的NucliSENS EasyQ HIV-1 V2.0使用NASBA艾滋病毒的扩增和定量目标gag区RNA(见表一)。此法的夫妇NASBA利用分子信标利用的NucliSENS EasyQ分析仪实时检测。NucliSENS EasyQ检测提供了高吞吐量的优势,只有中等技能要求。它也是一个完全自动化的,封闭的系统。但是,它需要专门的空间和设备,在高容量的实验室的污染是有风险的。技术支持是必需的,加入已经用这个方法成本高。
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