中国在主要学科方面全部进入前25名，国际科学论文的计量分析是对基础研究状况评价的重要参考。SCI科学引文索引数据库）收录我国科学家发表的论文总数从1991年的第15位上升到2004年的第5位（2005年继续坚持第5位）所占份额稳步快速增长；论文被引用次数从2002年的第19位上升到2005年第13位。对主要学科领域1992-2003年论文数、引文数、高被引论文数和热点论文数等指标的综合分析标明。其进展往往难以预测，基础研究厚积薄发。需要临时积累。政府将为基础研究提供稳定支持，以实现基础研究继续快速发展，显著提升我国原始性创新能力，为建设创新型国家发挥基础性和先导性作用。
其中数学、资料科学、化学、工程技术、物理学在基准线水平之上，地学和计算机科学处于基准线水平，生命科学整体上还处于基准线水平之下，但已出现强劲增长势头。例如，对细胞生物学和遗传学领域17个重要研究方向发展态势的分析标明，2001-2005年共有16个研究方向的论文总量进入世界前10名，绝大多数研究方向的被引次数开始进入世界前15名。特别值得一提的寂静了25年之后，2005年中国学者在生命科学顶尖杂志Cell上以第一作者身份发表论文5篇，加上参与国际合作的论文，共计有9篇，今年截至目前已在该杂志合作发表了7篇论文。另外，许多有应用价值的原始性研究效果已经形成重要专利。
近年来，国学者在获得重要国际奖励、国际组织和国际刊物任职方面一直是单薄环节。这种情况已有所改善。例如，近两年我国又有14位科学家荣获了欧洲物理学会菲涅尔奖、萨拉姆科技奖、杰出女科学家奖等国际科学奖，有4人当选为国际重要科学组织如国际科学院委员会主席、发展中国家科学院副院长等要职，有40人次当选为重要学术组织或其他国家科学院的院士（会士）有多人出任国际著名期刊重要职务，包括首次出任Scienc周刊评审编辑。
十五”期间，基础研究队伍不时发展壮大。据统计。国基础研究人员全时当量从2001年的7.88万人年增长到2005年的11.54万人年，增长了46.45%2005年，全国R&D人员全时当量为136.48万年，其中基础研究人员的全时当量占8.46%
国正在运行的国家重点实验室约200个，国注重基础研究基地建设。截至到目前。国家野外科学观测研究站网络不时发展完善，一批大科学工程装置已经建成并取得重要研究效果，中国科学院知识创新工程和教育部985工程在科研平台方面也给予高强度投入。通过这些基地的建设，使我国科学研究实验设施和研究环境得到明显改善。
国基础研究近年来发展加速，总体而言。大大缩短了与国际先进水平的差异，正在从量的扩张向质的提升转变，某些领域已进入国际前列。基础研究的快速发展无疑将大幅度提升我国的科技创新能力。
全国基础研究经费总投入年均增长19.4%目前，十五”期间。973计划和四个重大科学研究计划2006年立项工作已基本完成。
发展国家重点实验室体系的同时，基地建设方面。开展了国家实验室试点；为落实《规划纲要》精神，还探索在若干企业建立国家重点实验室，促进企业自主创新能力的提高。科学数据共享工程等国家科技基础条件平台建设方面，加强共享机制研究与实践。
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