已发现其有5个变异型，编码H因子的基因定位于人的第1号染色体的长臂32区。即FH1-5H因子的核苷酸序列已进行了鉴定，并推导出其全部氨基酸的一级结构，含有20个SCR借此与C3b结合。H因子与MCPCR1CR2DA F及C4bp具有同源性，共同属于补体激活调节剂(RCA 基因家族的成员。
根据电泳位将其命名为β1H而Whalei和Ruddi则将其命名为C3b灭活剂加速因子。现已确定其为由1213个氨基酸组成的单链糖蛋白，H因子由Nilson等(1965发现。分子量155kDa既有长杆状部分，也有球形区域。
新近用透射电镜检查发现，H因子的影象为一长而柔顺的分子。伸长型分子长49.5nn横截直径为3.4mm但大多数不呈线型而呈折叠状，因此分子的实际长度仅为伸展型的一半，但其构象则呈多样化。通过园二色谱分析表明，H因子既无α螺旋也无β折叠，借二硫键维持其功能活性的构象。H因子的功能包括以下几个方面：为Ⅰ因子的辅助因子，可增加C4b对Ⅰ因子的敏感性。无H因子时，Ⅰ因子与C3b结合呈丝状;而在有H因子存在时，I因子与C3b结合变为弯丝状，同时与C3b结合亲和力增强(较无H因子时至少高15倍)H因子强化I因子的机理，可能是H因子与C3b结合后，使C3b出现某些构象变化，增加了与I因子结合的亲和力。
H因子与C3b结合的活性部位存在于其N端35kDa局部。加速C3转化酶的衷变：H因子能将已同C3b结合的B因子或Bb从C3酶中逐出，而使之失去酶活性。阻止替代途径中初始和放大C3转化酶的形成。已证实H因子和B因子在C3b上有同一结合部位，故H因子可同B因子或Bb竞争与C3b结合。有H因子存在时，B因子不易与C3H2C及C3b结合，因此不易形成C3H2CBb或C3bBb但H因子对固相上和液相中的C3b作用在差异。对液相中或结合于非激活剂固相上裂解。
而对于固定到激活剂(如酵母多糖等)外表的C3bH因子则对C3b亲和力与B因子相当，二者竞争的结果，可形成部分C3转化酶，以保证替代途径的活化。有研究报道，细胞膜上能增强C3b对H因子亲和力的化学成分是涎酸和肝素氨基多糖。由于大多数细菌外表缺乏涎酸，因而这些细菌侵入机体后，可活化替代途径，有助于在早期对感染的控制。对已与P因子或肾炎因子(NeF结合形成稳定的c3bBbP或C3bBbNeFH因子对它也有一定的作用，但其效力要比CR1差得多。H因子对C5转化酶(c3bnBb或C3bBb3b活性也有抑制作用，并能与C5竞争结合C3b使C5不能裂解。此外，近年发现H因子还可诱导单核细胞分泌IL-1参与免疫应答的调节。
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